Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
YPEL4Q96NS1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YPEL4Q96NS1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms