Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COG8Q96MW5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG8Q96MW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms