Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKNOX2Q96KN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms