Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NMD3Q96D46 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms