Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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FAM3DQ96BQ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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