Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms