Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC63Q8NA47 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms