Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12Q8IYM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms