Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR49Q8IV35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms