Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKAP1Q86WV1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms