Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB4Q86W47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms