Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMC3Q7Z5M5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC3Q7Z5M5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms