Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARCQ7LC44 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms