Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMBQ6PCB8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMBQ6PCB8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms