Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RALGAPA1Q6GYQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms