Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPI1

CTRB2, Chymotrypsinogen B2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB2Q6GPI1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTRB2Q6GPI1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTRB2Q6GPI1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms