Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms