Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL1Q16048 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms