Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms