Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TUBA3CQ13748 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TUBA3CQ13748 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3CQ13748 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3CQ13748 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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