Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms