Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms