Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 KDM1A-205ENST00000494920 905 ntTSL 38.46□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 29.9
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SUB1P53999 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-40■■■■■ 29.4
SUB1P53999 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.042e-40■■■■■ 29.4
SUB1P53999 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.372e-40■■■■■ 29.4
SUB1P53999 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.622e-40■■■■■ 29.4
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SUB1P53999 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-22■■■■■ 29.4
SUB1P53999 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.743e-22■■■■■ 29.4
SUB1P53999 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.973e-22■■■■■ 29.4
SUB1P53999 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)6.74□□□□□ -1.333e-22■■■■■ 29.4
SUB1P53999 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.523e-22■■■■■ 29.4
SUB1P53999 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 29.3
SUB1P53999 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 29.3
SUB1P53999 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 29.3
SUB1P53999 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-15■■■■■ 29.3
SUB1P53999 EIF3M-206ENST00000526267 662 ntTSL 23.01□□□□□ -1.938e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 29.2
SUB1P53999 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 29.2
SUB1P53999 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 29.2
SUB1P53999 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.943e-9■■■■■ 29.2
SUB1P53999 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 29.2
SUB1P53999 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 29.2
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