Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSK3BP49841 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms