Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMUP48645 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMUP48645 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMUP48645 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMUP48645 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMUP48645 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMUP48645 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NMUP48645 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms