Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD52P43351 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD52P43351 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD52P43351 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD52P43351 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD52P43351 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD52P43351 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD52P43351 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD52P43351 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms