Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC1P35251 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC1P35251 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC1P35251 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC1P35251 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC1P35251 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC1P35251 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms