Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMLP26374 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMLP26374 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMLP26374 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMLP26374 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMLP26374 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMLP26374 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMLP26374 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMLP26374 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMLP26374 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMLP26374 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMLP26374 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMLP26374 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMLP26374 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMLP26374 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMLP26374 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMLP26374 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMLP26374 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMLP26374 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMLP26374 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMLP26374 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMLP26374 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms