Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA3P26006 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms