Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5F1P24539 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5F1P24539 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms