Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GCSHP23434 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCSHP23434 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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