Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSRP1P21291 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSRP1P21291 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms