Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD33P20138 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD33P20138 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD33P20138 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD33P20138 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD33P20138 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms