Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELK1P19419 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELK1P19419 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELK1P19419 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ELK1P19419 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELK1P19419 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELK1P19419 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELK1P19419 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms