Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT3P12035 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT3P12035 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT3P12035 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT3P12035 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT3P12035 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT3P12035 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT3P12035 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT3P12035 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT3P12035 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms