Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTMAP06454 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTMAP06454 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTMAP06454 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTMAP06454 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTMAP06454 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTMAP06454 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTMAP06454 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTMAP06454 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms