Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms