Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F6O75461 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F6O75461 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F6O75461 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F6O75461 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms