Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP2O75323 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms