Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SOX15O60248 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SOX15O60248 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SOX15O60248 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX15O60248 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms