Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC25A20O43772 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms