Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTSS1O43312 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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