Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K13O43283 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K13O43283 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms