Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRXO43186 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRXO43186 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRXO43186 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRXO43186 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRXO43186 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRXO43186 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRXO43186 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRXO43186 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRXO43186 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRXO43186 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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