Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 FHOD1-206ENST00000567561 773 ntTSL 310.53□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SPAG5-213ENST00000581133 743 ntTSL 310.53□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NUP35-209ENST00000479162 2828 ntTSL 210.46□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-207ENST00000549682 596 ntTSL 410.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 CNIH3-213ENST00000498126 778 ntTSL 310.27□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-264ENST00000557169 851 ntTSL 210.2□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SRRM2-203ENST00000570655 575 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SRRM2-207ENST00000571372 462 ntTSL 39.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 39.55□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-228ENST00000554277 410 ntTSL 59.51□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-253ENST00000556366 772 ntTSL 59.42□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-213ENST00000449431 545 ntTSL 49.34□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-269ENST00000557305 603 ntTSL 29.33□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-203ENST00000547604 276 ntTSL 39.29□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-213ENST00000551407 544 ntTSL 49.29□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ELP3-204ENST00000518112 2059 ntTSL 29.27□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FOXM1-206ENST00000536066 2518 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FOXM1-208ENST00000538564 693 ntTSL 39.12□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-215ENST00000602574 2290 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TIAL1-212ENST00000495821 372 ntTSL 28.79□□□□□ -13e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 EEF1E1-203ENST00000488226 443 ntTSL 28.56□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SRRM2-214ENST00000573451 441 ntTSL 38.55□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SLC30A6-209ENST00000457724 570 ntTSL 48.49□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FOXM1-205ENST00000535350 618 ntTSL 38.43□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 AKAP10-209ENST00000578898 475 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-BMI1-203ENST00000475460 508 ntTSL 28.28□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NUP35-202ENST00000374930 998 ntTSL 28.07□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 MEAF6-207ENST00000485039 814 ntTSL 28.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 USP36-204ENST00000586066 960 ntTSL 58.01□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 KIAA0556-204ENST00000565672 767 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 AMZ2-215ENST00000584494 897 ntTSL 37.64□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-212ENST00000550876 564 ntTSL 47.57□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 RUFY2-208ENST00000466493 2110 ntTSL 1 (best)7.55□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FXR1-212ENST00000476672 976 ntTSL 27.54□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-236ENST00000554531 669 ntTSL 47.52□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-262ENST00000557149 583 ntTSL 27.38□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 27.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-205ENST00000366204 572 ntTSL 47.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 OGT-208ENST00000472270 689 ntTSL 27.3□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDRG2-278ENST00000635386 672 ntTSL 37.09□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZNF100-203ENST00000594401 548 ntTSL 47.08□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 LONP2-209ENST00000570174 818 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-204ENST00000456711 748 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 56.84□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 26.75□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SLC25A40-205ENST00000470328 748 ntTSL 46.52□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 AKAP10-211ENST00000583951 236 ntTSL 36.49□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TRIM37-205ENST00000580122 482 ntTSL 56.4□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SLC30A6-206ENST00000440718 573 ntTSL 46.39□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ICE2-202ENST00000558121 3338 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDUFAF5-212ENST00000479716 493 ntTSL 36.15□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 26.09□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-214ENST00000552453 856 ntTSL 55.94□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 TPM4-203ENST00000586193 545 ntTSL 35.84□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-BMI1-206ENST00000602395 621 ntTSL 25.55□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-204ENST00000547620 567 ntTSL 45.31□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 CNOT10-217ENST00000485136 608 ntTSL 25.29□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ANKHD1-216ENST00000490185 829 ntTSL 25.26□□□□□ -1.572e-11■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 PRKCQ-AS1-220ENST00000625147 757 ntTSL 55.23□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 RUFY2-211ENST00000484083 686 ntTSL 35.19□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 KIAA0556-207ENST00000568258 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.16□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-212ENST00000479958 1443 ntTSL 25.14□□□□□ -1.593e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NUP35-206ENST00000452137 755 ntTSL 54.97□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FBXL5-211ENST00000513163 2554 ntTSL 1 (best)4.91□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NIPSNAP2-202ENST00000415967 872 ntTSL 34.9□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 GTF2F2-203ENST00000494087 1352 ntTSL 34.89□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ICE2-214ENST00000561124 544 ntTSL 44.87□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 COMMD3-BMI1-202ENST00000463409 605 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 ZDHHC17-209ENST00000550163 730 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NIPSNAP2-211ENST00000497279 4255 ntTSL 24.75□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDUFAF5-209ENST00000476536 763 ntTSL 54.59□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 34.51□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 NDUFAF5-204ENST00000464269 550 ntTSL 54.46□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 SLC30A6-208ENST00000454324 2359 ntTSL 24.36□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 44.6
SF3B1O75533 PRKCQ-AS1-214ENST00000615210 661 ntTSL 54.1□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 44.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 601.4 ms