Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TAC4-204ENST00000398154 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF621-203ENST00000403205 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ACTG1P12-201ENST00000423183 1166 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AP001469.3-202ENST00000430259 2014 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LINC00954-201ENST00000433669 2472 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CCNB1IP1-206ENST00000437553 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC112492.3-201ENST00000457557 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 C16orf52-204ENST00000562695 695 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC099804.1-201ENST00000623105 714 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CICP5-201ENST00000424045 2215 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 FAM13C-201ENST00000422313 1963 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PIGN-214ENST00000589720 1853 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC096637.2-202ENST00000421933 1846 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AP000350.2-201ENST00000439492 1763 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TUBD1-205ENST00000394239 1680 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SLC3A1-207ENST00000409741 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SLC17A2-201ENST00000265425 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MIR874-201ENST00000401190 78 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SEMA6A-AS1-205ENST00000512128 479 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC015853.2-201ENST00000571282 493 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AP2S1-209ENST00000601498 898 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.174-201ENST00000619127 283 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PAK3-206ENST00000425146 2477 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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