Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TUBD1-201ENST00000325752 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC01556-201ENST00000377186 466 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC099344.2-201ENST00000430897 1061 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC245884.9-201ENST00000596631 483 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC139099.4-201ENST00000625083 3504 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF319-201ENST00000299237 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MPP2-220ENST00000622681 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MAPK4-205ENST00000588540 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CCDC81-201ENST00000354755 2510 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C3orf14-206ENST00000494481 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MORN4-203ENST00000478953 2225 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PAK3-204ENST00000372010 2606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ELMOD3-205ENST00000409344 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ARAP3-205ENST00000513878 3810 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AF131215.4-201ENST00000526648 1741 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL445531.1-201ENST00000562653 1728 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SP140L-202ENST00000396563 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PAX6-258ENST00000639548 1417 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CNTN2-232ENST00000640428 4146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC073046.1-201ENST00000441217 390 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LHFPL3-AS1-206ENST00000449764 1196 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TG-208ENST00000519543 3132 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GALNT11-208ENST00000434507 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RIBC1-204ENST00000457095 1949 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF610-201ENST00000321287 2150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SLCO2A1-201ENST00000310926 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms