Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
V9GYH0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
V9GYH0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
V9GYH0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
V9GYH0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
V9GYH0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
V9GYH0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYH0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYH0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYH0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYH0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYH0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
V9GYH0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
V9GYH0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms