Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRRQ9UBK8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRRQ9UBK8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRRQ9UBK8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms