Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NKIRAS2Q9NYR9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms